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WisPacT

Das Wisconsin PackageTM Tutorial

Das Institut für Genetik, das Institut für Biochemie und das Zentrum für angewandte Informatik (Universitätsweiter Service) der Universität zu Köln haben einen Hypertext-Kurs zur DNA- und Protein-Sequenzanalyse entwickelt. 

(English version.)

DNA- und Protein-Sequenzanalyse

Im Bereich der medizinischen und biologischen Grundlagenforschung stellt die computergestützte Analyse von biochemisch gewonnenen Daten eine der grundlegenden Arbeitstechniken dar. Daher sind am Zentrum für Angewandte Informatik der Universität zu Köln das Wisconsin PackageTM der Genetics Computer Group (GCG) sowie verschiedene DNA- und Protein-Datenbanken installiert, die den Vergleich einer neu gewonnenen Erbinformation mit allen anderen weltweit bisher analysierten DNA- oder Protein-Sequenzen ermöglichen.

Ausbildung

Einmal pro Jahr findet ein fünftägiger Kurs zur Einführung in die Nutzung des Wisconsin PackageTM statt, der vom Institut für Biochemie in Zusammenarbeit mit dem Zentrum für Angewandte Informatik der Universität zu Köln durchgeführt wird. Während sich dieser fünftägige Kurs eher an Wissenschaftler und Studenten richtet, die bereits in den Labors tätig sind, bietet das Institut für Genetik für Studierende im Hauptstudium jeweils im Wintersemester ein Genetisches Praktikum für Fortgeschrittene an. Hier werden Studierende unterrichtet, die mit der Sequenzanalyse noch nicht vertraut sind und diese erst erlernen müssen. Das Institut für Genetik, das Institut für Biochemie und das Zentrum für Angewandte Informatik beschlossen im Januar 1997, einen WWW-Kurs zur DNA- und Protein-Sequenzanalyse zu erstellen, um eine bessere Betreuung der Studenten und Wissenschaftler zu erreichen.

WWW als Medium

Als Medium für diesen Kurs wurde das World Wide Web (WWW) ausgesucht. Nicht nur wegen seiner breiten Verfügbarkeit im wissenschaftlichen Bereich, sondern auch wegen der Möglichkeit, die Sequenzanalyse vom eigenen Arbeitsplatz direkt über WWW-Browser durchführen zu können, ist das World Wide Web das geeignete Medium zur Umsetzung und Verbreitung dieses Kurses. Zudem kann die Online-Dokumentation der Programmbeschreibungen abgerufen werden.

Ziele des WWW-Kurses

Der Kurs soll die Studenten, deren EDV-Vorbildung sehr unterschiedlich breit gefächert ist, an die DNA- und Protein-Sequenzanalyse heranführen und mit Hilfe von Übungsaufgaben die Möglichkeit geben, das erlernte Wissen zu überprüfen. Es sollen keine Computer-Experten ausgebildet werden, sondern der Umgang mit den verfügbaren Ressourcen vermittelt werden, so daß die Teilnehmer des Kurses befähigt werden, diese Mittel für die Lösung einer häufig vorkommenden Fragestellung zu nutzen. Gleichzeitig soll der Kurs als Infomationsquelle für Experten der Molekularbiologie und -medizin dienen, die von der Laborbank aus den Kurs als Nachschlagewerk zur Lösung akuter Fragen nutzen wollen.

Ausstellung auf der MEDICA 1999

Der Kurs wurde vom 17.11.99 - 20.11.99 auf der Düsseldorfer Messe MEDICA vorgestellt werden. Interessenten knnten sich auf dem Stand 13A05/06 in Halle 13 über das Design und die Ziele des Wisconsin PackageTM Tutorials informieren.

Verfügbarkeit

WisPacT liegt in deutscher Sprache vor. Einen Einblick in das Wisconsin PackageTM Tutorial bietet die WisPacT-Demo-Version mit reduziertem Inhalt. Nutzern des Wisconsin PackageTM aus der Universität zu Köln steht die Vollversion kostenlos zur Verfügung.

Bezugsquelle

WisPacT ist im Verlag A.Mönch erschienen: Sollten Sie an einer Intranet-Lizenz interessiert sein, wenden Sie sich bitte an
Volker Winkelmann.
Universität zu Köln
Zentrum für Angewandt Informatik
Robert-Koch-Str. 10
D-50931 Köln
gcgkurs@uni-koeln.de

Dr. Brigitte Kisters-Woike, Dr. Budi Tunggal, Volker Winkelmann, Elisabth Feldmar

Last modified: May 28, 2003